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Autor: Grupo de Bioinformática de la Carrera Ingeniería en Biotecnología, UADY

Identificación de la Región Variable Implicada en la Fijación de Dióxido de Carbono en la Rubisco de Plantas y Cianobacterias

La fotosíntesis es un proceso físicoquímico por el cual las plantas, algas, bacterias fotosintéticas y algunos protistas como diatomeas, utilizan la energía de la luz solar para sintetizar compuestos orgánicos. Se trata de un proceso fundamental para la vida sobre la tierra y tiene un profundo impacto sobre la atmósfera y el clima terrestres. Cada año los organismos con capacidad fotosintética convierten en carbohidratos más del 10% del dióxido de carbono atmosférico. Este proceso comienza con la fijación del dióxido de carbono por la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa/oxígenasa (Perez-Urria, 2009). La ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa/ oxígenasa o RuBisCo cataliza el primer paso en...

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Determinación de termoestabilidad de la ADN polimerasa IV por análisis de secuencias, vecindario y composición aminoacídica

Las enzimas sintetizadas por hipertermófilos (bacterias y arqueas con una temperatura de crecimiento óptima por arriba de 80°C), también llamadas enzimas hipertermófilas, son típicamente termoestables (esto es, resistentes a la activación irreversible a altas temperaturas) y óptimamente activas a altas temperaturas (Vieille, Zeikus 2001). Hoy en día, una gran diversidad de proteínas han sido identificadas como termófilas e hipertermófilas; es decir, que tienen la capacidad de funcionar a altas temperaturas (arriba de 50°C) mientras que las proteínas mesófilas tienen una actividad óptima entre 25°C y 50°C. Además, estas proteínas demuestran una incapacidad a funcionar a temperaturas por debajo de...

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Diseño y evaluación in silico de un gen Cry con actividad contra Conotrachelus aguacatae y Perseae

Uno de los problemas más importantes para la producción agrícola es el daño a los cultivos generado a causa de los insectos, virus y otros patógenos. Debido a esto, ha aumentado el interés comercial que implica el desarrollo de plantas transgénicas capaces de resistir plagas y enfermedades. Bacillus thuringiensis (Bt) es una bacteria gram positiva del suelo que durante la esporulación produce proteínas llamadas δ-endotoxinas, también conocidas como proteínas cry, las cuales son inclusiones parasporales proteicas que presentan efectos insecticidas contra una gran variedad de órdenes, como Lepidoptera, Diptera y Coleoptera (Xu et al, 2014). Cuando las inclusiones parasporales...

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USO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS PARA COMPRENDER PROCESOS DE COMUNICACIÓN ENTRE BACTERIAS

En los últimos años se ha descrito que al igual que los organismos pluricelulares, las poblaciones conformadas por organismos unicelulares (Ej. bacterias), las células mantienen un proceso de comunicación con el fin de coexistir de forma equilibrada e intercambiar información que les permita adquirir ciertas características benéficas para la población, tales como resistencia a antibióticos. Dicho proceso de comunicación celular recibe el nombre de Quorum Sensing, en el cual una acumulación de moléculas encargadas de transmitir señales (autoinductores), permiten que una célula individual perciba el número de bacterias (densidad celular) que tiene a su alrededor, mediante la detección y...

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